Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tdrd9Q14BI7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tdrd9Q14BI7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms