Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Gli2Q0VGT2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gli2Q0VGT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms