Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cpne7Q0VE82 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cpne7Q0VE82 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms