Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrioQ0KL02 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrioQ0KL02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms