Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kndc1Q0KK55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kndc1Q0KK55 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms