Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ttc21bQ0HA38 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ttc21bQ0HA38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms