Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ebf1Q07802 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ebf1Q07802 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms