Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CluQ06890 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CluQ06890 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CluQ06890 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CluQ06890 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CluQ06890 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CluQ06890 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CluQ06890 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CluQ06890 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CluQ06890 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CluQ06890 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms