Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prrx2Q06348 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prrx2Q06348 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms