Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cab39Q06138 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cab39Q06138 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms