Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cdk18Q04899 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms