Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ddr1Q03146 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ddr1Q03146 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms