Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EgfrQ01279 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EgfrQ01279 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EgfrQ01279 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms