Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2bQ01097 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Grin2bQ01097 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Grin2bQ01097 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms