Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rbp1Q00915 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rbp1Q00915 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms