Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cd80Q00609 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cd80Q00609 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms