Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbp10Q000W5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms