Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cds1P98191 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cds1P98191 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms