Protein–RNA interactions for Protein: P97357

Taf1a, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1aP97357 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Taf1aP97357 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Taf1aP97357 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms