Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gfi1P70338 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gfi1P70338 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms