Protein–RNA interactions for Protein: P70314

Pitx1, Pituitary homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx1P70314 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pitx1P70314 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pitx1P70314 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.7 ms