Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cux2P70298 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cux2P70298 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72 ms