Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vamp7P70280 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vamp7P70280 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms