Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chl1P70232 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chl1P70232 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms