Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snrpd1P62315 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snrpd1P62315 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms