Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp46P62069 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Usp46P62069 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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Usp46P62069 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp46P62069 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms