Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smg6P61406 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smg6P61406 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms