Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Scarf2P59222 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Scarf2P59222 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms