Protein–RNA interactions for Protein: P58334

Klf16, Krueppel-like factor 16, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf16P58334 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Klf16P58334 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klf16P58334 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms