Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Bace1P56818 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace1P56818 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Bace1P56818 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Bace1P56818 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms