Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TdgP56581 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TdgP56581 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TdgP56581 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TdgP56581 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TdgP56581 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TdgP56581 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TdgP56581 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TdgP56581 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 258.5 ms