Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rrp1P56183 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rrp1P56183 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms