Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Efnb1P52795 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Efnb1P52795 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms