Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Apobec1P51908 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Apobec1P51908 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms