Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccr5P51682 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccr5P51682 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms