Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa-rs12P50716 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa-rs12P50716 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms