Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Csrp3P50462 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Csrp3P50462 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms