Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd7P50283 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd7P50283 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd7P50283 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd7P50283 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms