Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VegfbP49766 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
VegfbP49766 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VegfbP49766 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfbP49766 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfbP49766 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfbP49766 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VegfbP49766 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms