Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Brca1P48754 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Brca1P48754 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms