Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rfx1P48377 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rfx1P48377 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rfx1P48377 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rfx1P48377 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rfx1P48377 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rfx1P48377 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 259.6 ms