Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rplp1P47955 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rplp1P47955 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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