Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zic1P46684 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zic1P46684 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zic1P46684 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms