Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rpl28P41105 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rpl28P41105 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rpl28P41105 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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