Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VhlP40338 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
VhlP40338 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
VhlP40338 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
VhlP40338 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
VhlP40338 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VhlP40338 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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