Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chd1P40201 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Chd1P40201 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd1P40201 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd1P40201 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Chd1P40201 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Chd1P40201 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms