Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lig1P37913 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lig1P37913 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lig1P37913 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms