Protein–RNA interactions for Protein: P35969

Flt1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt1P35969 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Flt1P35969 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Flt1P35969 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Flt1P35969 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Flt1P35969 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Flt1P35969 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flt1P35969 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flt1P35969 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flt1P35969 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flt1P35969 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Flt1P35969 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms