Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprkP35822 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PtprkP35822 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PtprkP35822 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprkP35822 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtprkP35822 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtprkP35822 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms