Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Celf1P28659 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Celf1P28659 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms